Do datové schránky firmy přišlo oznámení o zahájení daňové kontroly a jednatel neví, co ho čeká, jak dlouho to potrvá a co smí odmítnout. Daňová kontrola podle § 85 až 88a daňového řádu prověřuje daňové povinnosti firmy, nejčastěji konkrétní daň za určité období. Začíná doručením oznámení, během ní firma dokládá svá tvrzení a končí zprávou o daňové kontrole. Pevná maximální délka kontroly v zákoně není. Firma má právo vyjádřit se k výsledku a proti doměřené dani se odvolat.
Od daňové kontroly se liší kratší postup k odstranění pochybností.
Ve zkratce
- Kontrola začíná doručením oznámení o zahájení, proti němu se nelze odvolat.
- Důkazní břemeno ke svým tvrzením nese firma.
- K výsledku kontroly dostane firma přiměřenou lhůtu k vyjádření.
- Po zahájení kontroly už nelze podat dodatečné přiznání na kontrolovanou daň.
- Z doměřené daně vzniká penále 20 %, na žádost ho lze prominout.
- Pevná délka kontroly není, strop tvoří lhůta pro stanovení daně.
Kontrola, nebo postup k odstranění pochybností
| Otázka | Postup k odstranění pochybností | Daňová kontrola |
|---|---|---|
| Kdy | Pochybnosti o podaném přiznání před stanovením daně | Prověření daňových povinností kdykoli během lhůty pro stanovení daně |
| Zahájení | Výzva k odstranění pochybností | Doručení oznámení o zahájení |
| Lhůta k vyjádření | 15 dnů | Přiměřená lhůta |
| Výsledek | Protokol, případně přechod v kontrolu | Zpráva o daňové kontrole |
Výzva před kontrolou
Když má správce daně důvod domnívat se, že daň bude vyšší, měl by firmu nejdřív vyzvat k podání dodatečného přiznání podle § 145 odst. 2. Když kontrolu zahájí bez takové výzvy, ačkoli k ní byl důvod, nevzniká podle § 87 odst. 4 z doměřené daně penále. Jak dodatečné přiznání funguje, popisuje článek o dodatečném daňovém přiznání.
Průběh kontroly
Kontrola je zahájena doručením oznámení, které nemá odůvodnění a nelze se proti němu odvolat. Správce daně pak musí bez zbytečného odkladu začít skutečně prověřovat, jinak se lhůta pro stanovení daně neprodlouží od okamžiku zahájení. Od roku 2021 lze kontrolu zahájit, vést i ukončit korespondenčně, typicky přes datovou schránku.
Firma musí podle § 86 umožnit kontrolu, předložit účetnictví a doklady a poskytnout součinnost. Podle § 92 nese důkazní břemeno ke svým tvrzením a k údajům v přiznání. Správce daně prokazuje, když má pochybnosti o věrohodnosti předložených dokladů. Firma se může nechat zastoupit zmocněncem. Jak dlouho doklady uchovávat, vysvětluje článek o archivaci účetních dokladů.
Seznámení s výsledkem
Před ukončením kontroly seznámí správce daně firmu s dosavadním výsledkem a podle § 88 odst. 2 jí dá přiměřenou lhůtu k vyjádření a navržení dalších důkazů. Podle metodického pokynu GFŘ jde nejméně o 8 dnů. Pevných 15 dnů platí jen u postupu k odstranění pochybností. Kontrola končí zprávou o daňové kontrole podle § 88a. Od roku 2021 se zpráva neprojednává osobně a firma ji nemusí podepisovat.
Délka kontroly a lhůta pro stanovení daně
Pevnou nejdelší dobu kontroly daňový řád nestanoví, platí jen zásada, že se má postupovat bez zbytečných průtahů. Proti nečinnosti lze podat podnět podle § 38. Daň lze stanovit do 3 let od konce lhůty pro podání přiznání, kontrola lhůtu prodlužuje a nejzazší hranicí je 10 let. Když se daň nestihne pravomocně stanovit ve lhůtě, už ji podle rozšířeného senátu Nejvyššího správního soudu 1 Afs 231/2022 stanovit nelze.
Co následuje po kontrole
Když kontrola zjistí vyšší daň, vydá správce dodatečný platební výměr. Doměřená daň je splatná 15 dnů po nabytí právní moci výměru. Z doměřené daně vzniká podle § 251 penále 20 %, ze snížené ztráty 1 %. Dodatečné přiznání po zahájení kontroly na kontrolovanou daň podat nelze. Úrok z prodlení běží od původní splatnosti daně.
Proti výměru se lze odvolat do 30 dnů od doručení. Odvolání samo platbu neodkládá, doměřená daň je ale splatná až po právní moci. Proti rozhodnutí o odvolání lze do dvou měsíců podat žalobu ke krajskému soudu. Penále lze na žádost podanou do 3 měsíců prominout, podle míry součinnosti až do 75 % a z ospravedlnitelného důvodu i zcela. Pravidla pro DPH popisuje článek o kontrolním hlášení.
Šest zásad pro firmu v kontrole
Postup, který zkrátí kontrolu a sníží sankce.
- Připravte doklady k tvrzením v přiznání, důkazní břemeno je na vás.
- Zvažte zmocněnce, například daňového poradce.
- Spolupracujte, součinnost ovlivňuje prominutí penále.
- K výsledku se vyjádřete v určené lhůtě a navrhněte důkazy.
- Po výměru zvažte odvolání do 30 dnů.
- Požádejte o prominutí penále do 3 měsíců od právní moci.
Další daňová témata shrnuje náš průvodce fakturami, DPH a pohledávkami.
Časté otázky
Jak dlouho může trvat daňová kontrola?
Pevná nejdelší doba není. Hranicí je lhůta pro stanovení daně, nejdéle 10 let.
Mohu se odvolat proti zahájení kontroly?
Ne. Oznámení o zahájení kontroly nemá odůvodnění a odvolání proti němu není přípustné.
Kolik času mám na vyjádření k výsledku kontroly?
Přiměřenou lhůtu, podle pokynu GFŘ nejméně 8 dnů. 15 dnů platí u postupu k odstranění pochybností.
Mohu během kontroly podat dodatečné přiznání?
Na kontrolovanou daň a období ne, po zahájení kontroly je nepřípustné.
Jaké penále hrozí po kontrole?
20 % z doměřené daně, 1 % ze snížené ztráty. Na žádost ho lze prominout.
Kdy musím doměřenou daň zaplatit?
Do 15 dnů od právní moci dodatečného platebního výměru.
Zdroje
- Daňový řád, § 85 až 92, 143, 145, 148 a 251, zákon č. 280/2009 Sb. (zakonyprolidi.cz)
- Daňová kontrola, Finanční správa (financnisprava.gov.cz)
- Metodický pokyn GFŘ k daňové kontrole, Finanční správa (financnisprava.gov.cz)
- Rozsudek NSS 1 Afs 183/2014, Sbírka rozhodnutí NSS (nssoud.cz)
- Usnesení NSS 1 Afs 231/2022, Nejvyšší správní soud (nssoud.cz)




